1、一户多宅不能进行确权。过去土地还没有确权的时候，有的家庭可能会对应不止一个宅基地，而现在我们国家确权采用的是一户一宅的标准，也就是说一户只能够确权一个宅基地，多余的宅基地会被集体回收，因此除了一个宅基地可以确权之外，剩下多余的宅基地都不能进行确权。
2、耕地上建设的房屋，下面的土地不能确权。在宅基地确权的过程中，只要土地上面建设房屋，一般都能够进行宅基地确权，但是如果房屋建设在耕地上，房子就属于违建的房子，因为我们国家有严格的耕地红线，不能随便在耕地上建设房屋。因此即使在耕地上建设房屋，下面的宅基地也不能进行确权。
3、非集体内的人购买的宅基地。不管是农村的房子还是农村的宅基地，其流转都只能在集体内进行，农村集体外的人无法购买集体内部的宅基地，当然这也是为了保护集体内的土地资源。因此如果过去由村集体外的人违规购买了宅基地，是不能进行确权的。
4、存在争议的宅基地不能确权。在进行宅基地确权的过程中，有些宅基地的归属存在纠纷，对于存在纠纷的宅基地，暂时不能够进行确权，只有等解决完纠纷之后才能够进行确权。